Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIP1P30622 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms