Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMA1P25391 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms