Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIN3BO75182 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms