Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms