Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCG2Q9UNQ0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms