Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DKK4Q9UBT3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms