Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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LRFN1Q9P244 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRFN1Q9P244 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRFN1Q9P244 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRFN1Q9P244 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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