Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN4Q9NQP4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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