Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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