Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NIPSNAP1Q9BPW8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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NIPSNAP1Q9BPW8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NIPSNAP1Q9BPW8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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