Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GPA33Q99795 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms