Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FBXO38Q6PIJ6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO38Q6PIJ6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO38Q6PIJ6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO38Q6PIJ6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO38Q6PIJ6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO38Q6PIJ6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO38Q6PIJ6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO38Q6PIJ6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO38Q6PIJ6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms