Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms