Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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