Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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