Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN12Q05209 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms