Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YBX1P67809 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YBX1P67809 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
YBX1P67809 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms