Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPS4XP62701 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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