Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO4P61968 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LMO4P61968 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LMO4P61968 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO4P61968 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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