Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A2P55011 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms