Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMARCA4P51532 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCA4P51532 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms