Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms