Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRATP43155 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRATP43155 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRATP43155 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms