Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESRRAP11474 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms