Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIPRLO75663 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms