Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP2O75323 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms