Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EFCAB5A4FU69 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFCAB5A4FU69 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms