Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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KCNIP3Q9Y2W7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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KCNIP3Q9Y2W7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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KCNIP3Q9Y2W7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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KCNIP3Q9Y2W7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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KCNIP3Q9Y2W7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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KCNIP3Q9Y2W7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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