Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHANK2Q9UPX8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms