Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT172Q9UG01 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms