Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A6Q9P2U8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms