Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms