Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NLRP1Q9C000 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NLRP1Q9C000 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms