Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FYCO1Q9BQS8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FYCO1Q9BQS8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms