Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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ECHDC3Q96DC8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3Q96DC8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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