Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMARCE1Q969G3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms