Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RABGGTAQ92696 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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RABGGTAQ92696 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RABGGTAQ92696 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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