Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms