Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNG1Q06432 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms