Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms