Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab4aP56371 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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