Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms