Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMPOP42166 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMPOP42166 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMPOP42166 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMPOP42166 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMPOP42166 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMPOP42166 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMPOP42166 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms