Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms