Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LCHNA4D1U4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LCHNA4D1U4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms