Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249 ms