Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms