Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LHX6Q9UPM6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms