Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2IRD1Q9UHL9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2IRD1Q9UHL9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2IRD1Q9UHL9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2IRD1Q9UHL9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2IRD1Q9UHL9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2IRD1Q9UHL9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms