Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TDP1Q9NUW8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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